Beberapa bakteri dapat menginfeksi ikan baik ikan air tawar maupun ikan laut. Penyakit yang disebabkan bakteri adalah penyakit yang paling banyak menyebabkan kegagalan pada budi daya ikan air tawar. Penyakit infeksi bakteri masih sering terjadi dengan intensitas yang variatif. Umumnya pembudidaya masih mengandalkan antibiotik sebagai “magic bullet” untuk melawan penyakit akibat bakteri. Penyakit infeksi bakteri yang sering menyerang ikan air tawar, yaitu bakteri Aeromonas hydrophila, bakteri Streptococcus sp, dan bakteri Mycobacterium sp.
